秦惠文公的使者随后就到了卫鞅府中，使者当堂宣读了秦惠文公的旨意，收回卫鞅的相印，命令卫鞅即日离开咸阳，返回自己的封地。
卫鞅前脚刚刚离开咸阳，公子虔和公孙贾等人又联合上书，密告秦惠文公，说道：“卫鞅不知悔改，曾经僭越使用王宫仪仗，说明他有野心谋反，如果回到封地，一定会起兵谋反。”
秦惠文公于是下令逮捕卫鞅，派公孙贾带兵，三千连夜出城追赶。卫鞅得知后有追兵，心中明白是秦国新君和众臣不肯饶恕自己，于是赶紧跳下马车，换上便装，日夜逃窜。
这一天，卫鞅赶到函谷关时，又困又乏，心中想到：“出了函谷关，就逃出生天了。”看看天色已晚，于是找到一家客栈投宿。
客栈老板见来了客人，赶忙上前热情接待，并请卫鞅拿出照身帖，也就是官府开具的身份证明。卫鞅哪里敢拿出自己的帖子，于是谎称没有。老板的笑容顿时不见了，说道：“住店必须有照身帖，这是卫鞅大人的法制，如果私自留宿没有证明帖的人，无论是谁，是要被一起砍头的，我是真的不敢留您。”
卫鞅听了客栈老板的话，长叹一声，说道：“我当初设立的这个规定，今天可是害了我自己呀，我这就叫做自作自受。”
卫鞅没有别的办法，不敢再去找其他客栈投宿，而是连夜赶在城门关闭前，混出了关口。
卫鞅连夜出关后，马不停蹄逃到魏国。卫鞅想得到魏惠王的庇护，可是魏惠王非常恼怒卫鞅，恼怒他曾今在魏国为官，却多次带兵攻打过魏国。所以魏惠王连见都不肯见卫鞅一面，还派人去捉拿卫鞅，要送还秦国，卫鞅只好灰溜溜逃回秦国。
卫鞅刚回到自己封地，还没有来得及组织起兵，就被随后赶来的公孙贾包围逮捕。
卫鞅被带回咸阳后，秦惠文公历数卫鞅十条大罪，然后吩咐下去把卫鞅押到街口，在咸阳市曹使用最严酷的刑罚，也就是五牛分尸处死了卫鞅，连带卫鞅的族亲也一起被灭掉了。
消息传到大梁，魏申心中不免唏嘘起来。
想这个卫鞅（因为河西之战失败，秦国没有占领魏地商於，所以没有商鞅）在秦国帮助秦孝公变法图强，使得秦国迅速崛起，却落得个身首异处的下场。
卫鞅变法虽然富强了秦国，却并没有考虑过百姓的感受。所以秦国百姓因卫鞅变法对百姓过于苛刻，对于卫鞅之死也拍手称快，歌舞于道，如释重负。
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